基本給はかなり低い。総合職も同じです。しかし、地方と都内では地域手当てが出ますので大きく(5万程度)変わってきます。また、本省は残業が月に50時間以上、多い部署だと普通に100時間いくようなところもあります。残業代が出ますので、人によって給料は大きく異なると思います。私は地域手当て+残業代で基本給に加えて15万くらい貰っています。基本給はインターネットで出ているので調べてみて下さい。
部署や役職にもよりますが残業や休日出勤はあります。みんな心と体をけずって働いてるイメージです。
仕事の規模は大きいので、やりがいを感じる人は多いとは思います。個人的には規模が大きすぎて誰のためにやっているのかが分からなくなることも多々ありますが。